60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0258 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  100 
 
 		 397 aa  764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1984  peptidase M50  39 
 
 		 341 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0463  peptidase M50  38.95 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0511  peptidase M50  40.88 
 
 		 330 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0506  peptidase M50  37.73 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0921606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2710  peptidase M50  36.34 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  36.36 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  36.44 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0500  peptidase M50  47.84 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.394939  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1675  zinc protease, putative  34.99 
 
 		 317 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  40.07 
 
 		 315 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  40.07 
 
 		 315 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  40.74 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1470  peptidase M50  37.4 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4470  peptidase M50  43.46 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0087  hypothetical protein  43.72 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  38.02 
 
 		 550 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1707  peptidase M50  39.8 
 
 		 491 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2814  peptidase M50  36.59 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3285  peptidase M50  36.59 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00379295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  35.11 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  32.53 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5131  peptidase M50  41.71 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.628863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4003  peptidase M50  38.03 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0618882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3438  peptidase M50  39.8 
 
 		 491 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.526789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  33.1 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  36.09 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  35.63 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3483  peptidase M50  38.38 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1182  peptidase M50  35.74 
 
 		 326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0291  peptidase M50  38.54 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00037958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3682  peptidase M50  36.12 
 
 		 378 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3897  peptidase M50  33.48 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.725325  normal  0.5726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2489  peptidase M50  32.94 
 
 		 492 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.896404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1247  peptidase M50  36.02 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  34.33 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1070  peptidase M50  31.03 
 
 		 493 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0318096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2388  peptidase M50  33.67 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  29.51 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2035  peptidase M50  29.37 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2061  peptidase M50  29.37 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2307  predicted protein  29.46 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00988345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0417  peptidase M50  28.4 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  28.72 
 
 		 684 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44486  predicted protein  27.92 
 
 		 834 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.330794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2576  hypothetical protein  29.25 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000057775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  35.71 
 
 		 247 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  35 
 
 		 239 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  39.74 
 
 		 241 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  39.74 
 
 		 241 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  38.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  33.33 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  34.25 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  26.96 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  31.03 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>