More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0245 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  780    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  61.27 
 
 
379 aa  474  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  59.95 
 
 
380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  58.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  56.23 
 
 
381 aa  458  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  58.05 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
378 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  52.83 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  52.88 
 
 
387 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  52.76 
 
 
378 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  52.16 
 
 
374 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  48.13 
 
 
377 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  49.2 
 
 
378 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  53.16 
 
 
378 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  51.58 
 
 
380 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  50.26 
 
 
379 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  51.32 
 
 
381 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  49.47 
 
 
383 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.33 
 
 
381 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  51.18 
 
 
381 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  49.47 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.8 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.07 
 
 
381 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  49.2 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.8 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  50.79 
 
 
385 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 
384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
378 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 
380 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  44.71 
 
 
380 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  47.75 
 
 
380 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.69 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
421 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 
424 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
398 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
370 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
422 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
395 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
373 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
369 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
446 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
385 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
412 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
390 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.33 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.12 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.1 
 
 
650 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
426 aa  113  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
369 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  30.21 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
904 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
394 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
406 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
406 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
434 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
360 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
364 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.8 
 
 
371 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
382 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
355 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
374 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
398 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
386 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
395 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.62 
 
 
398 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
426 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
402 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
387 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
390 aa  106  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
383 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
371 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
411 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
355 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.38 
 
 
371 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
399 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.32 
 
 
423 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
378 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>