172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0241 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 481 aa  970    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  35.82 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  33.11 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  35.87 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  33.26 
 
 		 442 aa  259  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  33.18 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  33.26 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  34.13 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  33.05 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  30.57 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.95 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  27.84 
 
 		 651 aa  162  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  25.69 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.11 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  30.18 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.1 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.89 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  39.62 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  26.02 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.07 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.31 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.36 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  33.61 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 1153 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  28.75 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  28.75 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  27.46 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 380 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  30.11 
 
 		 403 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  28.4 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.4 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  28.64 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  27.22 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  22.55 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  31.3 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  27.44 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  28.71 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 		 1040 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25.38 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  27.45 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.91 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  29.76 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.46 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  23.11 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  30.11 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  30.39 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.03 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  27.68 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  30.97 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  25.58 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  25.58 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  26.96 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  30.88 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  25.52 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 373 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1856  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 368 aa  57  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  24.06 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  26.34 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.07 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  24.91 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  17.81 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  20.58 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  26.34 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.87 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>