More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0230 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  60.56 
 
 
556 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  59.37 
 
 
545 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  59.81 
 
 
535 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  61.42 
 
 
552 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  60.95 
 
 
564 aa  683    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  58.92 
 
 
544 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  61.08 
 
 
542 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
565 aa  1118    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  63.11 
 
 
548 aa  676    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  58.85 
 
 
554 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  59.65 
 
 
541 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  57.92 
 
 
554 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  58.65 
 
 
554 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  58.47 
 
 
555 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  57.92 
 
 
554 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  55.75 
 
 
539 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  58.64 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  55.41 
 
 
558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  57.22 
 
 
541 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  57.12 
 
 
540 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  56.99 
 
 
554 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  55.66 
 
 
541 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  55.6 
 
 
539 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 
563 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  54.77 
 
 
563 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  55.45 
 
 
563 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  56.56 
 
 
543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  56.72 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  56.72 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  57.23 
 
 
543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  55.39 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  52.9 
 
 
558 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  56.05 
 
 
542 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  56.65 
 
 
528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  52.54 
 
 
558 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  54.27 
 
 
565 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  46.35 
 
 
587 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.74 
 
 
615 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.86 
 
 
564 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  42.8 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.51 
 
 
548 aa  445  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  45.14 
 
 
536 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.39 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  45.35 
 
 
566 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  45.42 
 
 
532 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.7 
 
 
575 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  44.01 
 
 
531 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  44.78 
 
 
641 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  41.87 
 
 
638 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 
558 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.96 
 
 
559 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 
555 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.08 
 
 
541 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  44.52 
 
 
641 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 
555 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  45.54 
 
 
534 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  44.71 
 
 
530 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  44.78 
 
 
531 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  42.78 
 
 
552 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  43.01 
 
 
540 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  44.22 
 
 
530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  41.51 
 
 
555 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  44.22 
 
 
530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  44.22 
 
 
530 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  44.22 
 
 
531 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  43.6 
 
 
535 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 
530 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 
530 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 
530 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  44.03 
 
 
530 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 
546 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  44.3 
 
 
537 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 
546 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.66 
 
 
526 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  42.52 
 
 
556 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 
535 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  42.88 
 
 
565 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  41.62 
 
 
541 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  44.17 
 
 
546 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 
541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 
541 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  44.32 
 
 
529 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  43.05 
 
 
519 aa  421  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  44.77 
 
 
534 aa  422  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  42.37 
 
 
562 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  43.84 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  41.6 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  42.35 
 
 
535 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  46.35 
 
 
743 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  42.09 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  46.21 
 
 
589 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  43.22 
 
 
535 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>