More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0229 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 316 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  45.81 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  45.48 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  43.21 
 
 		 350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  42.9 
 
 		 350 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  42.9 
 
 		 350 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  44.44 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  43.19 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  45.6 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  41.21 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  43.48 
 
 		 311 aa  258  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  44.08 
 
 		 362 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  43.42 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  42.09 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  43.09 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  39.48 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.4 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  41.69 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  40.8 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  39.27 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  41.45 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  41 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  39.93 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  41.96 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.87 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  39.22 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  38.05 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  39.8 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 		 399 aa  208  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.05 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.05 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.68 
 
 		 394 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.83 
 
 		 384 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.82 
 
 		 384 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.59 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.31 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.98 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.7 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  32.68 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.84 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  34.68 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.68 
 
 		 274 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.66 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.54 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.54 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.82 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  31.94 
 
 		 321 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.91 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.69 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.11 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.82 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.38 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  31.92 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.3 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.53 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  28.08 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 557 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.04 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 		 544 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  30.98 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.86 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  27.38 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  32.63 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.54 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.66 
 
 		 532 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.53 
 
 		 398 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 		 531 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.25 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>