34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0228 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  43.82 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  45.42 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  44.35 
 
 		 344 aa  223  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  41.74 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  41.74 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  42.15 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  41.73 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  39.84 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  40.59 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  42.24 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  37.85 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  40.07 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  38.38 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  42.92 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  37.96 
 
 		 415 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  37.9 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  36.44 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  37.19 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  34.02 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  39.56 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  38.22 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.82 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  38.21 
 
 		 342 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  34.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  33.71 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  28.74 
 
 		 342 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  30.27 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  28.83 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  23.98 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  24.83 
 
 		 193 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>