More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0220 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 705 aa  1409    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  33.57 
 
 		 652 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.09 
 
 		 355 aa  293  7e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 		 299 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 		 299 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 		 308 aa  251  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  41.32 
 
 		 298 aa  250  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 		 306 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  41.19 
 
 		 312 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 		 311 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 387 aa  214  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 		 379 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 310 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 		 360 aa  204  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  41.2 
 
 		 313 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 290 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 336 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 324 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  31.15 
 
 		 297 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 311 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 		 324 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  31.15 
 
 		 297 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 293 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 		 333 aa  171  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 		 306 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 324 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 324 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 		 334 aa  160  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 329 aa  160  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 324 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  31.52 
 
 		 296 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 		 334 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 318 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 318 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  36.4 
 
 		 318 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 318 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 318 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 303 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 340 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 313 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 317 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 312 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 314 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 317 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 289 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 308 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 294 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 		 310 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 714 aa  143  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 334 aa  137  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 312 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 325 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 305 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 321 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 327 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 318 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 307 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.23 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 330 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 334 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.17 
 
 		 284 aa  114  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 304 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  28.68 
 
 		 301 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 679 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 331 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 305 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 296 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 296 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 296 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  29.28 
 
 		 330 aa  108  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 327 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 361 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 272 aa  104  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 378 aa  104  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 342 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 298 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 327 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 303 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.92 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 337 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 346 aa  102  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 336 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 298 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  40.98 
 
 		 260 aa  101  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.54 
 
 		 338 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.95 
 
 		 336 aa  101  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 305 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 		 342 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.06 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 314 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 1267 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 277 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  26.52 
 
 		 301 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 313 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>