More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0218 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  289  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
138 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  38.35 
 
 
145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
145 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  40.77 
 
 
133 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
134 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 
139 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
139 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
146 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  36.89 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.17 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.29 
 
 
161 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
162 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  33.61 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  33.61 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
163 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.69 
 
 
131 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
163 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.85 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.68 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  32 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.06 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.2 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  36.8 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.01 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.82 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  34.82 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.22 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.61 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.59 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  38.24 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.24 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.24 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.04 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.58 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.4 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.27 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.43 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.33 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.59 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.91 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.43 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  33.87 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.58 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  36.51 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.3 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.43 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.35 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.86 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>