More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0193 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  62.89 
 
 		 210 aa  274  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  65.1 
 
 		 195 aa  271  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  61.72 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  64.29 
 
 		 193 aa  261  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  67.93 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  60.38 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  64.48 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  58.65 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  65.75 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  60.53 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 		 199 aa  244  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  59.24 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  61.2 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  58.95 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  55.24 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  58.79 
 
 		 190 aa  230  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  62.71 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  62.71 
 
 		 190 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  59.57 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 		 187 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  59.56 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  62.15 
 
 		 190 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 181 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  54.13 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  59.55 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 186 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  59.04 
 
 		 201 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 181 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 181 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 		 186 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 195 aa  222  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 		 235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 181 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  53.05 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  58.1 
 
 		 181 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  57.8 
 
 		 185 aa  218  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  59.54 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  56.41 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  59.52 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  57.56 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  56.45 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.74 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  60.77 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 		 200 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  57.56 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  55.8 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 184 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 188 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  56.25 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  61.45 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 180 aa  211  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  50.97 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 182 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  50.74 
 
 		 435 aa  206  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  60.32 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  50.55 
 
 		 184 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 190 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  56.77 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 		 181 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  48.54 
 
 		 329 aa  202  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  57.14 
 
 		 185 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  54.69 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  55.98 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.08 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 193 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>