More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0180 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  100 
 
 		 115 aa  237  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  61.17 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  61.76 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  63.27 
 
 		 105 aa  147  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  68.82 
 
 		 107 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  68.82 
 
 		 107 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  59.22 
 
 		 108 aa  146  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  62.04 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  69.89 
 
 		 107 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  64.29 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  68.82 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  67.74 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  60.19 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  63.27 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  63.27 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  63.64 
 
 		 107 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  59.81 
 
 		 110 aa  144  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  64.95 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  63.27 
 
 		 107 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  67.74 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  62.24 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  60.95 
 
 		 109 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  57.55 
 
 		 109 aa  141  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  61.86 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  61.86 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  61.86 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  58.65 
 
 		 109 aa  140  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  68.89 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.73 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  58.33 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  61.22 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  58.65 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  57.43 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  57.27 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  137  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  137  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  57.14 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  56.07 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  62.24 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  59.8 
 
 		 106 aa  138  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  60.2 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  59.18 
 
 		 107 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  61.76 
 
 		 259 aa  136  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58.1 
 
 		 109 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  57.14 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  59.6 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  60 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  61 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  57.43 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  59 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  55.77 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  57.43 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  55.14 
 
 		 110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  60 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  57.28 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  59.8 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  55.77 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  59.41 
 
 		 105 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  55.77 
 
 		 107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  58.82 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  57.84 
 
 		 108 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  66.29 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  60 
 
 		 223 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  60.82 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  59.05 
 
 		 259 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  57.89 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  65.17 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.96 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  65.17 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  56.07 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  56.07 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>