More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0127 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 435 aa  896    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 		 440 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  64.07 
 
 		 438 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  65.22 
 
 		 441 aa  581  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  64.07 
 
 		 440 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  63.89 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  64.07 
 
 		 440 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  62.74 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 436 aa  557  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 422 aa  544  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  60.56 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.33 
 
 		 411 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 420 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  60.23 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.48 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.77 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  56.84 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.14 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  60.23 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  59.34 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.08 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.44 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  57.44 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.18 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.44 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  56.74 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.61 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.27 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.3 
 
 		 412 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.98 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  58.28 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.14 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  59.44 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>