56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0084 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1619    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  35.56 
 
 		 753 aa  340  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  37.23 
 
 		 757 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  29.95 
 
 		 928 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  28.51 
 
 		 825 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 		 1094 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  26.67 
 
 		 811 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  27.61 
 
 		 842 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  27.48 
 
 		 841 aa  217  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  27.27 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  26.52 
 
 		 864 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.99 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 781 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  28.66 
 
 		 825 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  26.28 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  26.44 
 
 		 822 aa  207  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  24.58 
 
 		 816 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  27.85 
 
 		 768 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 		 757 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  25.28 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  25.99 
 
 		 1479 aa  200  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  27.21 
 
 		 760 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  28.12 
 
 		 741 aa  197  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  28.69 
 
 		 759 aa  196  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  27.6 
 
 		 1193 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  25.77 
 
 		 802 aa  194  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  29.82 
 
 		 747 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  29.49 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  25.64 
 
 		 868 aa  191  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  27.14 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  29.55 
 
 		 742 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  25.23 
 
 		 803 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  25.39 
 
 		 786 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1139 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 		 991 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 824 aa  174  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  23.61 
 
 		 1164 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 		 940 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 835 aa  164  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  32.36 
 
 		 837 aa  148  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  25.78 
 
 		 788 aa  146  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  33.25 
 
 		 762 aa  146  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  23.54 
 
 		 796 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  32.26 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  23.75 
 
 		 943 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  26.17 
 
 		 831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  27.35 
 
 		 856 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 781 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  23.36 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.54 
 
 		 773 aa  97.8  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  27.27 
 
 		 770 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  29.82 
 
 		 819 aa  95.1  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  25.97 
 
 		 809 aa  92  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  32.68 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.81 
 
 		 750 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>