More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0077 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0077  ribosomal protein L31  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3545  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1949  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3248  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  43.06 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  45.33 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  45.95 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  47.83 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  46.58 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1072  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0920129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  40.85 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0261  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  40.54 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1380  50S ribosomal protein L31  40.85 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.404223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  44 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  40.85 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  47.76 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  44.93 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2095  ribosomal protein L31  43.84 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.022397  hitchhiker  0.000114899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3190  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1043  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  41.43 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2704  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0557953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1659  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1716  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1201  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.779096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  44 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0186  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  39.44 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  45.07 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3511  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210627  normal  0.267982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3665  50S ribosomal protein L31  43.66 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  42.25 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  41.79 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6943  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.714042  normal  0.777909 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1430  ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.332477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0988  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3885  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0789422  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5333  50S ribosomal protein L31 type B  41.46 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  41.33 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  41.33 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0340  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0471  50S ribosomal protein L31  43.06 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  37.18 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  42.65 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2661  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>