27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0076 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 837 aa  1693    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2743  glycoside hydrolase family protein  53.88 
 
 		 863 aa  868    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2677  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 855 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2124  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 		 905 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545663  normal  0.891513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  21.78 
 
 		 649 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.18 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 895 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 1224 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  20.68 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  27.35 
 
 		 906 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  23.11 
 
 		 587 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.39 
 
 		 998 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  29.61 
 
 		 864 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.13 
 
 		 867 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  21.28 
 
 		 646 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.47 
 
 		 900 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  25.1 
 
 		 739 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.71 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.35 
 
 		 665 aa  47.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  19.38 
 
 		 885 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 632 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.39 
 
 		 927 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  25.68 
 
 		 1100 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.29 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  30.08 
 
 		 574 aa  46.2  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  26.44 
 
 		 775 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  22.25 
 
 		 571 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>