55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0074 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 834 aa  1673    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.88 
 
 		 837 aa  794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  44.36 
 
 		 816 aa  733    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  43.7 
 
 		 823 aa  744    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.5 
 
 		 829 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.69 
 
 		 860 aa  789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.01 
 
 		 863 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.04 
 
 		 862 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  31.27 
 
 		 836 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  29.76 
 
 		 885 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  29.82 
 
 		 858 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 871 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 852 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 911 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.2 
 
 		 887 aa  359  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.18 
 
 		 848 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.76 
 
 		 850 aa  349  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.49 
 
 		 845 aa  346  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.74 
 
 		 848 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.8 
 
 		 831 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1057 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.74 
 
 		 840 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  24.35 
 
 		 923 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.82 
 
 		 874 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  24.51 
 
 		 983 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.92 
 
 		 906 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.62 
 
 		 942 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  27.52 
 
 		 932 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  29.39 
 
 		 931 aa  88.6  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.33 
 
 		 910 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.69 
 
 		 923 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.95 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  27.27 
 
 		 592 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  24.64 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.35 
 
 		 619 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.05 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.59 
 
 		 627 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.59 
 
 		 581 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.38 
 
 		 659 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.49 
 
 		 581 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  23.41 
 
 		 1247 aa  48.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  39.66 
 
 		 425 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.35 
 
 		 613 aa  47.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.71 
 
 		 658 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 361 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  22.22 
 
 		 610 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.22 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.19 
 
 		 627 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.19 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.19 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  28.93 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.19 
 
 		 683 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.02 
 
 		 580 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.19 
 
 		 684 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>