198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0070 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 396 aa  801    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  40.05 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  35.47 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  35.81 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  35.81 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  36.32 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  36.08 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  35.05 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  35.53 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  38.24 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  34.66 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  35.64 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  34.22 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  35.47 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  36.08 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  34.02 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  34.72 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  36.24 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  35.81 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  35.2 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  33.08 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  32.63 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  34.86 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  35.15 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  35.06 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  33.94 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  34.91 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  36.83 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  34.32 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  34.28 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  34.26 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  34.11 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  36.05 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  34.03 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  37.2 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  34.38 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  35.22 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  34.7 
 
 		 375 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  32.37 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  32.56 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  35.54 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  30.08 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  27.74 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  34.1 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  29.53 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  31.36 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  29.77 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  27.48 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  32.22 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  31.94 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  29.9 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  29.63 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  32.38 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  30.08 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  32.03 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  30 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.42 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.83 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  30.75 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  29.41 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  30.38 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  28.02 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  27.49 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  27.99 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  28.83 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  30.52 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.42 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4060  putative D-serine deaminase (d- serine dehydratase) protein  27.92 
 
 		 425 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166728  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  27.85 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  29.28 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  27.94 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  28.83 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  26.57 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  30.16 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  25.19 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  26.06 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7000  alanine racemase domain protein  27.27 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4022  D-serine deaminase  29.37 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25.8 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0639  putative D-serine deaminase (d-serine dehydratase) protein  27.66 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.209216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  28.29 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  30.67 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0544  D-serine deaminase  27.61 
 
 		 426 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  27.18 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  28.02 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  30.33 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0656  hypothetical protein  27.11 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  39.44 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.57 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0672  hypothetical protein  27.11 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0661  D-serine deaminase  28.11 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  27.86 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  27.75 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0834  D-serine deaminase  26.87 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2130  amino acid aldolase or racemase-like  26.41 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2768  amino acid aldolase or racemase-like protein  26.41 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>