55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0063 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  100 
 
 		 409 aa  806    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  76.15 
 
 		 392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1013  integrase domain protein SAM domain protein  39.02 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.256622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  24.54 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  25.64 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  24.32 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  24.51 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  22.56 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  22.82 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  24.04 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  23.53 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  23.74 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  24.24 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  22.16 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  21.73 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  21.73 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  27.54 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  20.71 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.51 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  23.55 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  20.87 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.08 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.98 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.65 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.98 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  24.33 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  27.34 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  22.88 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.25 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  23.79 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  29.15 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  27.69 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  21.17 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  28.92 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  21.17 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.12 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0850  integrase family protein  20.95 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.55 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.92 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.73 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  32.03 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  30.43 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>