More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0059 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 219 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  48.33 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  52.2 
 
 		 207 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  51.22 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  53.23 
 
 		 503 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  49.52 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  46.6 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  44.5 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  44.08 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  47.31 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  41.04 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  35.71 
 
 		 200 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  38.86 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  46.01 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  30 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  45.96 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  34.22 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  30.24 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  42.21 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.97 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.57 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.06 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  31 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  32.4 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  36.91 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.99 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  40.95 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  30.56 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  34.41 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  30.67 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  44.33 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  31.55 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  30.99 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.59 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.74 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  32.89 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  30.99 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  31.69 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  41.76 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  27.51 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  34.95 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.41 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>