220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0050 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 902 aa  1770    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 753 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.32 
 
 		 888 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 831 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  19.77 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  25.99 
 
 		 866 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 875 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  21.63 
 
 		 772 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  19.97 
 
 		 789 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  21.24 
 
 		 792 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.62 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 897 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 852 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1154 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  19.9 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  20.17 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  20.83 
 
 		 872 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  19.9 
 
 		 923 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 803 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 1182 aa  71.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  18.85 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 772 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1066 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1147 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1092 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 759 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 814 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 1094 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  40.51 
 
 		 1192 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.87 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1080 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1173 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  22.76 
 
 		 1186 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  24.86 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1102 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1089 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 813 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1132 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 777 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 800 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1138 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 966 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  21.24 
 
 		 1205 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 818 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1116 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  45.07 
 
 		 853 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 923 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1086 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 973 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 1099 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1102 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 789 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 888 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  20.63 
 
 		 1185 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  35.71 
 
 		 877 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 817 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 952 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 		 1114 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1109 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1097 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  35 
 
 		 381 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 763 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1109 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1127 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  21.67 
 
 		 780 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1179 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1152 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  34.94 
 
 		 409 aa  55.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 817 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.22 
 
 		 865 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 760 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  24.78 
 
 		 740 aa  54.7  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 836 aa  54.7  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  18.9 
 
 		 917 aa  54.7  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 791 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 716 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 779 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 760 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 1165 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 1004 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 833 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  22.18 
 
 		 1219 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  22.51 
 
 		 1127 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>