More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0033 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
431 aa  868    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
450 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  48.39 
 
 
450 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  49.77 
 
 
449 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  47 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  46.79 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  47.93 
 
 
443 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  48.16 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  47.93 
 
 
443 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  46.77 
 
 
443 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  46.77 
 
 
443 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  45.98 
 
 
451 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  45.39 
 
 
450 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  44.01 
 
 
448 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  44.24 
 
 
449 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  45.01 
 
 
450 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  45.01 
 
 
450 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  46.33 
 
 
447 aa  381  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  46.03 
 
 
446 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 
449 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  44.57 
 
 
448 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  44.37 
 
 
449 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 
445 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  43.78 
 
 
450 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  44.24 
 
 
450 aa  363  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  43.88 
 
 
426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  44.87 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  43.09 
 
 
452 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  43.09 
 
 
448 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  41.18 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  41.28 
 
 
426 aa  329  6e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  37.99 
 
 
427 aa  318  1e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  42.49 
 
 
424 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  34.7 
 
 
457 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 
432 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  34.11 
 
 
477 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  33.95 
 
 
448 aa  203  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  33.95 
 
 
448 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  36.04 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  33.41 
 
 
479 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  34.92 
 
 
449 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.84 
 
 
445 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  34.24 
 
 
450 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  36.63 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.35 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  34.21 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 
446 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  29.64 
 
 
434 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  33.73 
 
 
430 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  34.25 
 
 
464 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  28.67 
 
 
438 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  29.4 
 
 
437 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  34.96 
 
 
473 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 
437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  32.33 
 
 
450 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 
447 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  34.63 
 
 
437 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 
439 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 
460 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  32.72 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  35.5 
 
 
433 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  31.59 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.01 
 
 
435 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  28.88 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
422 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  26.77 
 
 
402 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.43 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  27.86 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  28.77 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 
406 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 
407 aa  126  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 
406 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 
406 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  31.45 
 
 
526 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  31.45 
 
 
526 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  30.33 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  30.09 
 
 
526 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  30.16 
 
 
528 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf108  glucose-6-phosphate isomerase  26.46 
 
 
440 aa  108  1e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.621836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  30.16 
 
 
529 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  29.31 
 
 
532 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 
528 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  29 
 
 
533 aa  106  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1215  glucose-6-phosphate isomerase  32.13 
 
 
501 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0709148  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 
552 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  29.4 
 
 
529 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  26.29 
 
 
568 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.17 
 
 
948 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  32.51 
 
 
538 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  29.16 
 
 
527 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>