More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0009 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  69.53 
 
 		 237 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  68.53 
 
 		 235 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  70.26 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  68.67 
 
 		 236 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  67.67 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  66.52 
 
 		 235 aa  328  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  65.4 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  64.98 
 
 		 240 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  66.95 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  65.09 
 
 		 239 aa  325  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  66.81 
 
 		 239 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  65.52 
 
 		 236 aa  321  7e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  65.95 
 
 		 235 aa  321  8e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  63.79 
 
 		 239 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  63.56 
 
 		 240 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.7 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  63.52 
 
 		 239 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  63.95 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  63.09 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.16 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  63.09 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  62.98 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  64.66 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  65.09 
 
 		 235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.74 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.74 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  61.54 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  61.04 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  62.34 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  60.43 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  59.83 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  62.34 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  63.09 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  63.09 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  59.83 
 
 		 244 aa  301  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  62.34 
 
 		 242 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.77 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  61.9 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  61.54 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  60.68 
 
 		 236 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  60.68 
 
 		 236 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  59.92 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  61.04 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  60.68 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  61.64 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  61.64 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  60.76 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  61.64 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  59.23 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  291  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  61.37 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  61.11 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  57.21 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  56.28 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  55.41 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.51 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  57.21 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.26 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  56.15 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.28 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.72 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  60.26 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  57.94 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  54.98 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.98 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  56.65 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  61.97 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  58.4 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.51 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.56 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  60.68 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.02 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  55.79 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.55 
 
 		 245 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  56.65 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  57.08 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  57.51 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  56.84 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  61.11 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  56.84 
 
 		 236 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  59.32 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  56.47 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.26 
 
 		 239 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>