More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0006 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  100 
 
 		 133 aa  270  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  60.47 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.46 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  59.06 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  60.98 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  54.62 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  58.27 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  60.63 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 160 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3074  ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2680  ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 159 aa  143  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  51.13 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 188 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 166 aa  141  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  56.1 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 158 aa  139  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>