73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7183 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  100 
 
 		 362 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  92.27 
 
 		 362 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  80.99 
 
 		 363 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  62.89 
 
 		 362 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  61.9 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.28 
 
 		 765 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  52.33 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  52.92 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  51.57 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  51.58 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  53.22 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  51.29 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  51.29 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  48.9 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.44 
 
 		 475 aa  252  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  34.35 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  28.67 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.7 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  31.05 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  27.74 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  25 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  26.58 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.58 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.27 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.27 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.27 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.27 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.27 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.52 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  27.59 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.26 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  25.31 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  22.74 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  24.09 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.7 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  23.9 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  24.76 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.17 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  22.95 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  25.97 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  23.03 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  22.59 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0394  alkane 1-monooxygenase  25.21 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  23.08 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  21.36 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  40.74 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  40 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  36.92 
 
 		 495 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  29.66 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  23.35 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  23.48 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  21.53 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  22.43 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  32.22 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>