More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7144 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  100 
 
 
632 aa  1288    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  80.71 
 
 
637 aa  1030    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  96.2 
 
 
632 aa  1225    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
594 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  42.47 
 
 
617 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
607 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.27 
 
 
614 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.9 
 
 
597 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  38.95 
 
 
592 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.69 
 
 
608 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.46 
 
 
635 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  37.37 
 
 
609 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  39.97 
 
 
600 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  38.09 
 
 
602 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.89 
 
 
623 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.86 
 
 
597 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.97 
 
 
592 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.14 
 
 
611 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  38.83 
 
 
602 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.88 
 
 
594 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.33 
 
 
625 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
600 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.61 
 
 
592 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.05 
 
 
609 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
603 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.63 
 
 
594 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
600 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  37.88 
 
 
625 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.9 
 
 
602 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  35.11 
 
 
588 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.51 
 
 
614 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.33 
 
 
593 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.74 
 
 
610 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.64 
 
 
589 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  37.54 
 
 
616 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  34.87 
 
 
588 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.74 
 
 
610 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  35.56 
 
 
610 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
615 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.25 
 
 
586 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.35 
 
 
617 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.63 
 
 
591 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.41 
 
 
610 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.78 
 
 
598 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
598 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.85 
 
 
556 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.68 
 
 
589 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 
598 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.64 
 
 
609 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  36.4 
 
 
598 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.64 
 
 
610 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.48 
 
 
592 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.81 
 
 
598 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
600 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.09 
 
 
597 aa  362  8e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.22 
 
 
620 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.54 
 
 
620 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.09 
 
 
597 aa  362  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.94 
 
 
587 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.02 
 
 
650 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  41.67 
 
 
625 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
598 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.11 
 
 
598 aa  361  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.57 
 
 
598 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  35.64 
 
 
587 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.95 
 
 
598 aa  359  7e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.51 
 
 
587 aa  359  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.42 
 
 
587 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  35.42 
 
 
587 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
587 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
587 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.42 
 
 
587 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.82 
 
 
621 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.42 
 
 
587 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.09 
 
 
602 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  33.89 
 
 
614 aa  357  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  34.63 
 
 
613 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.24 
 
 
587 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.09 
 
 
598 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.71 
 
 
611 aa  355  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 
598 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 
598 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.09 
 
 
598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.97 
 
 
587 aa  351  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.16 
 
 
585 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.3 
 
 
598 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.99 
 
 
590 aa  350  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.45 
 
 
607 aa  350  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.61 
 
 
611 aa  349  7e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.11 
 
 
584 aa  349  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  35.34 
 
 
629 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.21 
 
 
587 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.77 
 
 
1257 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  34.38 
 
 
612 aa  347  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 
587 aa  346  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.4 
 
 
602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.84 
 
 
594 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.48 
 
 
597 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.97 
 
 
578 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>