215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7116 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  69.73 
 
 		 194 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  69.19 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  61.98 
 
 		 192 aa  263  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  51.32 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  56.04 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  54.95 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  50.82 
 
 		 203 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  49.45 
 
 		 204 aa  208  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  50.82 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  48.63 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  49.72 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  44.96 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  25.39 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  28.96 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.71 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  26.34 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  23.49 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  34.15 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  22.99 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  25.69 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  30.7 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.6 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  23.23 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.09 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  24.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 239 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.35 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  33.33 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1936  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  32.09 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  24.35 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07021  isochorismatase hydrolase family protein  25.22 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0832  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2871  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1609  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  31.03 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.34 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  23.48 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  24.31 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  27.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  24.07 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  26.43 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  34.43 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>