135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7099 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  100 
 
 
276 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  94.57 
 
 
276 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  62.32 
 
 
276 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  62.41 
 
 
276 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 
313 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  44.61 
 
 
296 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  41.09 
 
 
301 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  40.36 
 
 
285 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  40.36 
 
 
285 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  40.71 
 
 
320 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  44.07 
 
 
349 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  44.07 
 
 
301 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  39.86 
 
 
298 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 
308 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  37.55 
 
 
275 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  39.41 
 
 
305 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 
308 aa  205  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  40.15 
 
 
282 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  37.09 
 
 
304 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 
309 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  34.06 
 
 
284 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  33.8 
 
 
603 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
333 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.65 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  34.21 
 
 
279 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 
309 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  35.85 
 
 
295 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.44 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  33.8 
 
 
607 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
295 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.45 
 
 
305 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  32.27 
 
 
280 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  29.93 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  30.29 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 
320 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.65 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  30.03 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
287 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  27.76 
 
 
280 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.97 
 
 
323 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.49 
 
 
320 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.87 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.95 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.76 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.41 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  23.02 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.7 
 
 
323 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  22.62 
 
 
314 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  23.57 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.2 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  21.03 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  21.65 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.22 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.42 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.65 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  30.39 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  25 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.25 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.82 
 
 
312 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  24.48 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.17 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  23.32 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  19.88 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
395 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  21.71 
 
 
393 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  20.64 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  35.62 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.81 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  22.5 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  22.5 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.81 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  22.81 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  22.1 
 
 
305 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  22.1 
 
 
305 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  22.1 
 
 
305 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  22.1 
 
 
305 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  22.44 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  20.7 
 
 
307 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  22.1 
 
 
311 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  20.06 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
256 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  22.1 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  19.47 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  32.18 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  22.92 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  21.94 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  22.36 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  22.36 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>