More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7064 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1046 aa  2132    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  64.44 
 
 
1055 aa  1330    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.2 
 
 
1122 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
1048 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.09 
 
 
1175 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.16 
 
 
1105 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 
1043 aa  349  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  31.04 
 
 
1065 aa  346  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
1227 aa  342  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.05 
 
 
1377 aa  322  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
1037 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.51 
 
 
1141 aa  304  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 
1148 aa  293  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
1151 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1138 aa  283  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
1151 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1139 aa  280  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
1403 aa  267  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.65 
 
 
1149 aa  261  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
1398 aa  254  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.26 
 
 
1402 aa  238  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.39 
 
 
1134 aa  225  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 
1027 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
1093 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
1198 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1311 aa  218  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.77 
 
 
1358 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
1027 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
1027 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 
1160 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.04 
 
 
1080 aa  205  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.05 
 
 
1087 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.4 
 
 
1089 aa  204  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.03 
 
 
1023 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.43 
 
 
1081 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
1096 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 
1123 aa  202  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
1142 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
1094 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.27 
 
 
1117 aa  191  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  25.49 
 
 
1133 aa  191  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 
1349 aa  182  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.6 
 
 
1014 aa  180  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.94 
 
 
1291 aa  179  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 
1348 aa  178  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
1050 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.76 
 
 
1050 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.69 
 
 
1055 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.64 
 
 
1067 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.08 
 
 
1053 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
1349 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
1349 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  24.7 
 
 
1342 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 
1063 aa  166  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.29 
 
 
1422 aa  165  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.07 
 
 
1403 aa  163  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  28.68 
 
 
1353 aa  162  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.92 
 
 
1360 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  29.1 
 
 
1213 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  29.1 
 
 
1350 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  29.1 
 
 
1359 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  29.1 
 
 
1359 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
1359 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  29.4 
 
 
1359 aa  151  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
1429 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  29.4 
 
 
1359 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 
914 aa  149  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 
956 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.76 
 
 
805 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.61 
 
 
1271 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
1204 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.6 
 
 
1226 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.07 
 
 
1289 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  24.72 
 
 
1126 aa  129  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.32 
 
 
1441 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.61 
 
 
1169 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.68 
 
 
1153 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.01 
 
 
1295 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 
1285 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
703 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
1298 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 
665 aa  108  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.48 
 
 
1190 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 
738 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  23.85 
 
 
1130 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  27.19 
 
 
1071 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
479 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.84 
 
 
1264 aa  101  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 
954 aa  98.2  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 
1022 aa  97.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.5 
 
 
638 aa  95.5  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.32 
 
 
611 aa  94.7  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 
529 aa  94.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
284 aa  94.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
526 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 
900 aa  94  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 
641 aa  92  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  26.96 
 
 
460 aa  91.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 
1346 aa  91.3  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  31.49 
 
 
662 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>