17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6917 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  83.12 
 
 
78 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  81.82 
 
 
78 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  82.89 
 
 
82 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  76.32 
 
 
76 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  48 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  37.18 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5865  hypothetical protein  73.68 
 
 
40 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  37.66 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0178  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  35.21 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  30.26 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  30.26 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5289  hypothetical protein  37.18 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.726061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>