More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6898 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  64.9 
 
 
334 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  64.57 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  64.9 
 
 
341 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  62.25 
 
 
307 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  65.56 
 
 
325 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  60.6 
 
 
325 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  58.94 
 
 
306 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  59.93 
 
 
319 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  59.54 
 
 
315 aa  367  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  61.33 
 
 
322 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  59.41 
 
 
327 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  60.8 
 
 
332 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  60.07 
 
 
304 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  58.75 
 
 
310 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  60.6 
 
 
324 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  59.67 
 
 
295 aa  351  8e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  58.42 
 
 
317 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  58.14 
 
 
311 aa  340  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  57.14 
 
 
308 aa  339  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  57.63 
 
 
291 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  54.07 
 
 
337 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  54.33 
 
 
300 aa  318  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  57.97 
 
 
291 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  57.97 
 
 
291 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  55.41 
 
 
299 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  51.34 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  51.34 
 
 
351 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  50.95 
 
 
384 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  50.31 
 
 
329 aa  299  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  49.68 
 
 
390 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  52 
 
 
337 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  52.86 
 
 
299 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  49.05 
 
 
408 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  48.89 
 
 
421 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  48.89 
 
 
377 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  57.48 
 
 
306 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  51.34 
 
 
291 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  51.34 
 
 
341 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  47.37 
 
 
409 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.22 
 
 
367 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  53.04 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  51.83 
 
 
331 aa  288  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  50.67 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50.32 
 
 
338 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  50.5 
 
 
330 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  51.33 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  52 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  47.12 
 
 
384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  50.49 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  52 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  50.17 
 
 
351 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  53.2 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 
349 aa  281  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  48.42 
 
 
375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  45.36 
 
 
312 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  46.36 
 
 
318 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.41 
 
 
303 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  45.42 
 
 
301 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  44.59 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  43.67 
 
 
303 aa  221  9e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  42.39 
 
 
361 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  42.86 
 
 
352 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 
308 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  43.77 
 
 
309 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  42.16 
 
 
349 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.59 
 
 
319 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  41.83 
 
 
349 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  41.5 
 
 
349 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  41.5 
 
 
349 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  41.5 
 
 
347 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  41.18 
 
 
349 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  39.66 
 
 
351 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.49 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.7 
 
 
259 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  34.72 
 
 
510 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  34.88 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.47 
 
 
751 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.56 
 
 
369 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  29.55 
 
 
742 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
517 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.43 
 
 
614 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.86 
 
 
325 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.61 
 
 
314 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.51 
 
 
829 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  31.1 
 
 
316 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.72 
 
 
433 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 
517 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.04 
 
 
826 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.52 
 
 
586 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.42 
 
 
481 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.85 
 
 
338 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 
554 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.73 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
1818 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.27 
 
 
390 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.77 
 
 
348 aa  95.9  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
861 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.99 
 
 
412 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>