More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6775 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  86.38 
 
 
213 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  64.8 
 
 
220 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  62.44 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  58.01 
 
 
206 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
474 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.79 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.44 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.75 
 
 
484 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
207 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.19 
 
 
495 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  51.56 
 
 
492 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.75 
 
 
465 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.85 
 
 
484 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.05 
 
 
225 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.74 
 
 
202 aa  205  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.23 
 
 
480 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.61 
 
 
485 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.02 
 
 
485 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.17 
 
 
476 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.41 
 
 
211 aa  197  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  51.5 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
496 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  52.13 
 
 
477 aa  191  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.02 
 
 
224 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.51 
 
 
224 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.4 
 
 
209 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48 
 
 
428 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.57 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.79 
 
 
224 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.09 
 
 
491 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  48.97 
 
 
211 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.79 
 
 
230 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.79 
 
 
230 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.91 
 
 
485 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.6 
 
 
485 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.02 
 
 
485 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.83 
 
 
229 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.3 
 
 
217 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.04 
 
 
479 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.39 
 
 
493 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 
476 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.97 
 
 
214 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.26 
 
 
208 aa  174  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.7 
 
 
223 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.6 
 
 
493 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.37 
 
 
217 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.82 
 
 
217 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  51.45 
 
 
218 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
490 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.8 
 
 
229 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.4 
 
 
223 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  50.87 
 
 
218 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.96 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.87 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.87 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.92 
 
 
244 aa  164  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  49.71 
 
 
218 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.34 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.94 
 
 
216 aa  161  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.11 
 
 
207 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.55 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.32 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.62 
 
 
546 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.33 
 
 
206 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.69 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.76 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.57 
 
 
217 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.88 
 
 
210 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.24 
 
 
245 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  41.99 
 
 
507 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.25 
 
 
193 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.25 
 
 
193 aa  121  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.33 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.21 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.52 
 
 
187 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.51 
 
 
207 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.55 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.24 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  39.76 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.2 
 
 
249 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.49 
 
 
200 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  38.83 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.65 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.93 
 
 
300 aa  114  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.71 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.41 
 
 
358 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.67 
 
 
315 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  39.89 
 
 
433 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  38.15 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.02 
 
 
317 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.77 
 
 
345 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.77 
 
 
367 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  41.07 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.18 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.05 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.14 
 
 
276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.33 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  39.33 
 
 
468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  39.33 
 
 
455 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>