189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6773 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.62 
 
 		 271 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  59.33 
 
 		 277 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.92 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.6 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.15 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.09 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.69 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  54.82 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.77 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  50.85 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.85 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.91 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.77 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.6 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.15 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 		 231 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  35.22 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.23 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.9 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.12 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 328 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.77 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  33.9 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.31 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.19 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.19 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.85 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.09 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.12 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.85 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.45 
 
 		 338 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  37.45 
 
 		 338 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.93 
 
 		 1153 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  28.69 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.84 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 		 837 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  30.08 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.82 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.13 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  27.53 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.63 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.48 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.48 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  30.04 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.22 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>