More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6767 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  94.58 
 
 		 240 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  81.74 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  77.78 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  74.04 
 
 		 242 aa  351  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3551  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.68 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.79 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.33 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.18 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.71 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.93 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  35.43 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  34.33 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  29.95 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.33 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  36.06 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.4 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  33.5 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.74 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  32.76 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.16 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  36.99 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  31.51 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.73 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  33.5 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.82 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32.86 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  30.67 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.33 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.38 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.59 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  32.56 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.62 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.53 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  32.54 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.47 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  32.33 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  32.34 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.86 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  33.01 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  33.01 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.02 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.91 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  30.46 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.51 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  33.17 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.72 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  37.91 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.21 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.18 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  31.51 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  33.02 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 273 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>