More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6738 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  63.56 
 
 
266 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  56.89 
 
 
285 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  55.07 
 
 
276 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  56.58 
 
 
271 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
284 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  49.36 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  52.91 
 
 
272 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  51.11 
 
 
282 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  52.63 
 
 
287 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 
283 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  48.18 
 
 
410 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  47 
 
 
410 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  46.12 
 
 
410 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
414 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
420 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
304 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
394 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
298 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.8 
 
 
309 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
229 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
327 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
325 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
411 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.03 
 
 
382 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
393 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.81 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
476 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.63 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
346 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
238 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
386 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
305 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
308 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
374 aa  92  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.82 
 
 
412 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  32.27 
 
 
406 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  31.86 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  30.3 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.84 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
472 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
318 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
414 aa  88.6  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
308 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
430 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
310 aa  87.8  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  30.4 
 
 
502 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.12 
 
 
233 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.49 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
307 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
321 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
314 aa  85.5  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.44 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.44 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
315 aa  85.5  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  30.94 
 
 
476 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.16 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.9 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.41 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.52 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.36 
 
 
864 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  30.14 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>