More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6718 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  49.65 
 
 		 719 aa  688    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  57.28 
 
 		 718 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  63.48 
 
 		 740 aa  953    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  100 
 
 		 719 aa  1466    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  41.71 
 
 		 815 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  40.24 
 
 		 754 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  38.98 
 
 		 745 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.49 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 863 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 		 750 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  37.4 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 829 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 806 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  37.11 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 		 829 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 724 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 778 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 819 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 747 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 831 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 794 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 820 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 723 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.79 
 
 		 801 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.71 
 
 		 808 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.7 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  34.58 
 
 		 729 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 812 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  34.88 
 
 		 701 aa  363  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  34.11 
 
 		 729 aa  363  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.11 
 
 		 729 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 717 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 828 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 740 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.95 
 
 		 733 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 		 828 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.5 
 
 		 806 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  34.02 
 
 		 729 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.89 
 
 		 747 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  33.69 
 
 		 745 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 736 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 726 aa  357  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.41 
 
 		 797 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 828 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.89 
 
 		 747 aa  356  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.74 
 
 		 747 aa  356  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  33.74 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.74 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.97 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 797 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 721 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 		 828 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  34.43 
 
 		 718 aa  352  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 745 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 752 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 741 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 736 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 736 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 753 aa  350  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.55 
 
 		 791 aa  349  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.49 
 
 		 703 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 738 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.49 
 
 		 703 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  33.19 
 
 		 753 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  33.19 
 
 		 753 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  35.41 
 
 		 791 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 733 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 810 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 737 aa  347  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 729 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  32.31 
 
 		 752 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 745 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 747 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  33.74 
 
 		 747 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 789 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 754 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 734 aa  342  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 754 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  33.61 
 
 		 724 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 696 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 735 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 748 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 808 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 750 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 757 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 771 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 753 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 728 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 728 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 779 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 771 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 797 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>