70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6654 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
160 aa  313  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  83.85 
 
 
161 aa  262  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  44.52 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  41.61 
 
 
163 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2132  protein of unknown function DUF606  48.95 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.947377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2291  hypothetical protein  47.76 
 
 
178 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1691  hypothetical protein  38.85 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.119542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  25.35 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  36.81 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.45 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  27.97 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.86 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  32.06 
 
 
386 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  32.8 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  27.97 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  27.97 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  27.97 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  26.57 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  26.57 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  26.57 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  26.57 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  26.39 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  33.6 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  29.58 
 
 
140 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  34.82 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  33.04 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  33.04 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.04 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  29.92 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.75 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  29.86 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  35.42 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  28.17 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  33.86 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  31.63 
 
 
144 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.69 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  33.91 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  30.71 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  34.15 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  37.21 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.08 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  29.79 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  23.68 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  31.16 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.79 
 
 
309 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.79 
 
 
309 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.59 
 
 
317 aa  44.3  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  29.58 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  37.21 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  26.53 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  35.9 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  28.24 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  33.7 
 
 
162 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  28.32 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  28.09 
 
 
148 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  33.59 
 
 
335 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.05 
 
 
318 aa  41.2  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  28.06 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2213  hypothetical protein  22.88 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.44 
 
 
148 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>