69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6606 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1136 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1169 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  86.35 
 
 		 1100 aa  1943    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  55.23 
 
 		 1076 aa  1177    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  100 
 
 		 1094 aa  2240    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  37.5 
 
 		 1145 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  34 
 
 		 1113 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1117 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  33.84 
 
 		 1095 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1117 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  37.54 
 
 		 1195 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  25.49 
 
 		 2880 aa  90.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  24.54 
 
 		 2905 aa  88.6  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  23.67 
 
 		 2932 aa  85.9  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  24.31 
 
 		 2881 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  25.75 
 
 		 2779 aa  82.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  24.8 
 
 		 2868 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 2831 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  22.42 
 
 		 2860 aa  76.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  25.1 
 
 		 2748 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  24.41 
 
 		 2874 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  23.12 
 
 		 849 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  22.92 
 
 		 2922 aa  75.1  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  23.08 
 
 		 2786 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.84 
 
 		 2901 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.63 
 
 		 2868 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  22.87 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.15 
 
 		 2859 aa  70.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  24.64 
 
 		 2833 aa  70.1  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.43 
 
 		 2731 aa  69.7  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  24.87 
 
 		 2716 aa  69.7  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  23.92 
 
 		 2875 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.39 
 
 		 2793 aa  68.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  22.22 
 
 		 2916 aa  68.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.22 
 
 		 2732 aa  68.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  22.94 
 
 		 2864 aa  67  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  24.18 
 
 		 2888 aa  66.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  24.27 
 
 		 2864 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  22.55 
 
 		 2887 aa  65.1  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  23.51 
 
 		 2747 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  21.89 
 
 		 2823 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  23.01 
 
 		 2839 aa  63.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  21.81 
 
 		 2929 aa  62.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.17 
 
 		 2839 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  23.14 
 
 		 2845 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  23.4 
 
 		 2758 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  23.4 
 
 		 2748 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  24.05 
 
 		 2730 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  22.33 
 
 		 2761 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  23.74 
 
 		 811 aa  57.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  21.07 
 
 		 786 aa  56.6  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  24.21 
 
 		 2842 aa  54.7  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  24.69 
 
 		 3021 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  22.48 
 
 		 1303 aa  53.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 2769 aa  52.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  22.94 
 
 		 822 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  24.22 
 
 		 831 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  31.71 
 
 		 2870 aa  49.3  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  26.7 
 
 		 815 aa  48.9  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.22 
 
 		 801 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  22.85 
 
 		 2864 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.71 
 
 		 811 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  21.36 
 
 		 813 aa  46.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  21.36 
 
 		 813 aa  46.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  23.87 
 
 		 822 aa  46.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  28.86 
 
 		 815 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  21 
 
 		 811 aa  45.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  26.95 
 
 		 811 aa  45.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  28.38 
 
 		 827 aa  44.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>