81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6525 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  76.16 
 
 
648 aa  1048    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
647 aa  1344    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  49.13 
 
 
640 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  48.27 
 
 
648 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  47.96 
 
 
640 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  45.64 
 
 
640 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  42.62 
 
 
640 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  39.55 
 
 
652 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  39.47 
 
 
656 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  39.31 
 
 
656 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  38.85 
 
 
651 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  39.16 
 
 
667 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  42.61 
 
 
638 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  38.69 
 
 
651 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  38.69 
 
 
651 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  38.69 
 
 
651 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  39.16 
 
 
659 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  38.69 
 
 
651 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  42.41 
 
 
636 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  38.94 
 
 
679 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  40 
 
 
659 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  40.61 
 
 
620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  39.62 
 
 
617 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  39.87 
 
 
620 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  35.26 
 
 
646 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  37.77 
 
 
656 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  35.42 
 
 
800 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  39.45 
 
 
647 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  36.01 
 
 
666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  36.85 
 
 
634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  37.17 
 
 
634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  34.29 
 
 
742 aa  405  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.43 
 
 
655 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  34.47 
 
 
648 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  36.11 
 
 
628 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  35.09 
 
 
629 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  31.15 
 
 
665 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  31.33 
 
 
680 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.09 
 
 
652 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.51 
 
 
684 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  30.62 
 
 
673 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  32.54 
 
 
686 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  29.72 
 
 
672 aa  293  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  32.12 
 
 
643 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  30.63 
 
 
629 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  34.99 
 
 
397 aa  264  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  30.96 
 
 
643 aa  250  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  29.62 
 
 
643 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  28.75 
 
 
633 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  31.43 
 
 
654 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  24.53 
 
 
602 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  27.24 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.37 
 
 
711 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  29.04 
 
 
596 aa  90.9  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.94 
 
 
677 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 
1025 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.85 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.8 
 
 
963 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  23.93 
 
 
667 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  19.75 
 
 
955 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  24.4 
 
 
678 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  24.35 
 
 
838 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  25 
 
 
684 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  22.42 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  21.77 
 
 
663 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  22.16 
 
 
675 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  27.96 
 
 
783 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  20.67 
 
 
765 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  22.66 
 
 
844 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  25.76 
 
 
632 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  20.27 
 
 
795 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.57 
 
 
669 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  20.7 
 
 
795 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  20.9 
 
 
795 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.25 
 
 
771 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.09 
 
 
803 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  19.61 
 
 
792 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  23.65 
 
 
614 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  25.78 
 
 
749 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  24.61 
 
 
881 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  25.34 
 
 
744 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>