More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6500 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.41 
 
 		 465 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.97 
 
 		 464 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 465 aa  929    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 		 464 aa  626  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.45 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.24 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.24 
 
 		 464 aa  618  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.95 
 
 		 452 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3190  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2299  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.31 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.947723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.31 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1033  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.31 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.889645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1408  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1319  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.31 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2301  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.75 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3064  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.65 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.86 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.65 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.86 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 463 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.82 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3466  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.05 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.146186  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3745  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4404  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.3 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3965  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.64 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1450  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 		 459 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1873  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.02 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0779  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.32 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.18 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.69 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.26 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.79 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.67 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.21 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.51 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.68 
 
 		 475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.26 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 		 473 aa  356  5.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.22 
 
 		 481 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 		 476 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 		 484 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 476 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 476 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.91 
 
 		 469 aa  339  5e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.84 
 
 		 466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 		 467 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 		 474 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 603 aa  335  9e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 472 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 		 607 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.47 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 475 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>