78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6472 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  50.48 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
232 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  38.54 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  38.54 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  39.91 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  38.91 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  34.21 
 
 
218 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  32.12 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  28.92 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  31.87 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  31.87 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  31.87 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  29.7 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  31.12 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  30.69 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  30.69 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  30.65 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  33.97 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  30.43 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  30.65 
 
 
242 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  30.9 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  31.38 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25.77 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  27.72 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.28 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  31.19 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  30.81 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  31.19 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  33.51 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  31.31 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  32.81 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  32.04 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  25.79 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  26.15 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  30.81 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.82 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  27.07 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  27.42 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.34 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.34 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.74 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  25.26 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  30.83 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.74 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  27.54 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  29.21 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.85 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  27.32 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  29.21 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  30.71 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.89 
 
 
221 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.17 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.43 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  29.55 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  21.51 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  26.06 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.83 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  24 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  25.6 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  20.86 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  28.24 
 
 
215 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  22.46 
 
 
213 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>