More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6450 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  95.05 
 
 
222 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  76.47 
 
 
223 aa  351  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  65.85 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  60.73 
 
 
225 aa  270  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  62.21 
 
 
231 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  61.75 
 
 
231 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  62.1 
 
 
236 aa  267  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.53 
 
 
230 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  61.29 
 
 
229 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  57.75 
 
 
228 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  58.45 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  55.66 
 
 
236 aa  251  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  56.62 
 
 
240 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  57.6 
 
 
233 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  57.99 
 
 
226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  57.97 
 
 
240 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 
226 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  53.24 
 
 
232 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  56.73 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  59.9 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  59.9 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  48.48 
 
 
281 aa  232  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  55.09 
 
 
222 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  55.09 
 
 
222 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  55.09 
 
 
222 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  50.66 
 
 
232 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  49.33 
 
 
231 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  48.2 
 
 
227 aa  208  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  49.76 
 
 
227 aa  206  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 
234 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  46.15 
 
 
233 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  46.61 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  42.79 
 
 
230 aa  198  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  46.85 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  46.95 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  44.89 
 
 
389 aa  195  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 
234 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 
239 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  46.23 
 
 
230 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 
239 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  46.22 
 
 
233 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  43.56 
 
 
230 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 
241 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  44.8 
 
 
239 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  46.41 
 
 
247 aa  184  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  40.81 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
240 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.26 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.63 
 
 
241 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
264 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 
224 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.33 
 
 
231 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.88 
 
 
230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.88 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.88 
 
 
230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.88 
 
 
231 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
248 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.45 
 
 
231 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
233 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.45 
 
 
231 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.63 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.77 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
193 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
243 aa  91.7  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.68 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  28.44 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.28 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
220 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 
190 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 
247 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.85 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.52 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.75 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.85 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.85 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>