More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6440 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  91.45 
 
 		 387 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  63.95 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  59.21 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  58.14 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  43.3 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  39.8 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  39.53 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  43.52 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  41.53 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  38.83 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  41.62 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  36 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  36.72 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  41.9 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  42.18 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  36.65 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  36.53 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  34.99 
 
 		 387 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  35.34 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  28.29 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.24 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  31.39 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  27.52 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  30.15 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.4 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  32.2 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.84 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.6 
 
 		 400 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  29.83 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  28.25 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  27.95 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  30.9 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  26.81 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  30.06 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.36 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  30.61 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.01 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  27.03 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  30.68 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.49 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  30.59 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  28.78 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.46 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  28.41 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  28.93 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  29.8 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2494  aminotransferase  29.11 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  31.74 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.42 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  29.19 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 380 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  31.13 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  26.61 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  26.77 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  29.11 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  33.02 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  28.06 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  24.48 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  27.56 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  25.73 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.42 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  29.21 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  32.95 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  30.18 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.27 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  26.96 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  26.51 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  24.68 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.66 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  27.08 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  25.7 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  28.24 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  29.55 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  28.77 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  28.24 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  26.78 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  28.24 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  29.39 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.74 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  27.75 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  27.19 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>