225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6367 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  92.55 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  71.94 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  63.64 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  53.97 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  52.57 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  50.82 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  45.24 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.84 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  43.65 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  45.88 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 258 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  47.26 
 
 		 277 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.93 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  42.63 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  43.44 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  42.63 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  41.04 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  41.32 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  42.75 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  44.49 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  43.65 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  41.13 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  41.13 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  45.16 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  39.18 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  43.27 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  40.71 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  41.13 
 
 		 274 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  44.08 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  41.83 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  41.84 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  42.04 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  43.67 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  37.65 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  43.27 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  37.65 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  42.46 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  42.46 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  42.46 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  42.54 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  44.94 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  42.28 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  39.51 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.77 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>