More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6342 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  100 
 
 
291 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  87.97 
 
 
291 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  78.2 
 
 
291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  78.75 
 
 
293 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  78.32 
 
 
294 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  78.4 
 
 
293 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  78.32 
 
 
294 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  79.24 
 
 
289 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  77.32 
 
 
292 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  77.24 
 
 
290 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  75.09 
 
 
297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  76.6 
 
 
286 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  76.24 
 
 
286 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  78.97 
 
 
297 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  76.95 
 
 
286 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  76.6 
 
 
286 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  78.2 
 
 
291 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  76.6 
 
 
286 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  76.6 
 
 
286 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  75.95 
 
 
293 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  77.16 
 
 
291 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  72.66 
 
 
300 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  73.01 
 
 
292 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  70.69 
 
 
292 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  69.42 
 
 
315 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  70.14 
 
 
288 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  70.03 
 
 
287 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  67.35 
 
 
302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  68.53 
 
 
293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  67.96 
 
 
287 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  66.44 
 
 
292 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  61.94 
 
 
311 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  60.55 
 
 
293 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  59.21 
 
 
290 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  58.48 
 
 
292 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  59.22 
 
 
310 aa  328  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
294 aa  308  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  57.56 
 
 
274 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
275 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  49.16 
 
 
322 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01361  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  74.85 
 
 
177 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01373  hypothetical protein  74.85 
 
 
173 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
285 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
285 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
285 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
292 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  46.9 
 
 
292 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  46.9 
 
 
292 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
291 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  46.21 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  46.83 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
289 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  47.1 
 
 
309 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  45.94 
 
 
279 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  43.66 
 
 
281 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
293 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  44.52 
 
 
293 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  47.93 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  46.95 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  43.1 
 
 
286 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  46.48 
 
 
294 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  43.26 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
296 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  42.29 
 
 
288 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  40.93 
 
 
293 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  43.01 
 
 
290 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  44.13 
 
 
295 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  41.58 
 
 
283 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  42.61 
 
 
300 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  40.34 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  41.44 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
304 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  40.22 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
285 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  41.75 
 
 
302 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
335 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
292 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
292 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  40.28 
 
 
287 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
280 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  42.75 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
300 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
287 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5118  aldo/keto reductase  41.58 
 
 
309 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.456075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  38.78 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
290 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
287 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  40.07 
 
 
291 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3205  aldo/keto reductase  37.79 
 
 
319 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0370321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  39.65 
 
 
281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
268 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
285 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  32.89 
 
 
329 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.89 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>