More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6257 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  63.3 
 
 
255 aa  283  1e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  39.73 
 
 
223 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  41.05 
 
 
222 aa  145  4e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  39.45 
 
 
219 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  39.49 
 
 
242 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  41.46 
 
 
228 aa  140  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  42.72 
 
 
217 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.91 
 
 
232 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.59 
 
 
228 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  43.41 
 
 
225 aa  134  1e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  38.84 
 
 
244 aa  131  8e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  38.59 
 
 
233 aa  131  8e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  38.84 
 
 
244 aa  131  8e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  38.84 
 
 
228 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  40.5 
 
 
240 aa  131  1e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  40.5 
 
 
240 aa  130  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  36.46 
 
 
228 aa  130  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  36.28 
 
 
230 aa  130  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  42.02 
 
 
217 aa  130  2e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  39.7 
 
 
260 aa  130  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
240 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  38.89 
 
 
218 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  38.39 
 
 
228 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  38.04 
 
 
224 aa  129  5e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  43.33 
 
 
223 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  36.74 
 
 
228 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 
228 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.78 
 
 
231 aa  127  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  34.8 
 
 
246 aa  127  2e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  39.51 
 
 
228 aa  127  2e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  34.68 
 
 
229 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.44 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  125  4e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.95 
 
 
228 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.24 
 
 
219 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  37.91 
 
 
224 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  34.09 
 
 
229 aa  125  8e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  39.89 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  37.62 
 
 
219 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.32 
 
 
223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.34 
 
 
229 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  42.57 
 
 
245 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  41.49 
 
 
218 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.34 
 
 
229 aa  120  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  35.98 
 
 
223 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.1 
 
 
229 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  36.57 
 
 
252 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  35.98 
 
 
223 aa  119  4e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.67 
 
 
214 aa  119  4e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  37.02 
 
 
216 aa  117  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  34.98 
 
 
231 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
230 aa  114  1e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  38.92 
 
 
223 aa  113  2e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  34.36 
 
 
237 aa  114  2e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  39.34 
 
 
224 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.13 
 
 
223 aa  112  4e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
212 aa  112  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  39.34 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  39.34 
 
 
231 aa  112  7e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  31.31 
 
 
221 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.15 
 
 
229 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  30.35 
 
 
221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
226 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.71478e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  30.35 
 
 
221 aa  109  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  30.35 
 
 
221 aa  109  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  30.35 
 
 
221 aa  109  4e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  34.62 
 
 
208 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  30.13 
 
 
230 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  29.59 
 
 
223 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.87 
 
 
223 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  29.35 
 
 
221 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
235 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  28.86 
 
 
221 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  29.41 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  29.41 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  33.95 
 
 
230 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  29.41 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
221 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  29.41 
 
 
221 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
221 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  34.08 
 
 
215 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  35.36 
 
 
225 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  29.35 
 
 
221 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  29.59 
 
 
222 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  31.95 
 
 
221 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  36.04 
 
 
227 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  38.6 
 
 
204 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
218 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.25 
 
 
231 aa  99  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.27 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.93 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>