More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6255 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 		 545 aa  1098    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  68.21 
 
 		 544 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  86.72 
 
 		 543 aa  945    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  70.68 
 
 		 547 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  61.73 
 
 		 534 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  66.04 
 
 		 540 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  62.29 
 
 		 538 aa  651    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  71.89 
 
 		 544 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  68.21 
 
 		 544 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  61.54 
 
 		 534 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  56.9 
 
 		 544 aa  590  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  52.72 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  45.44 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  45.37 
 
 		 545 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  45.56 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  45.56 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  48.97 
 
 		 547 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  47.3 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  45.01 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  43.1 
 
 		 528 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  42.56 
 
 		 542 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  42.56 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  41.75 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  42.4 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  40.41 
 
 		 527 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  42.08 
 
 		 528 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  41.46 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  39.32 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  39.67 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  40.52 
 
 		 758 aa  335  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 		 621 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  37.83 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  37.98 
 
 		 541 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.96 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  32.33 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.98 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.92 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.17 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  32.19 
 
 		 577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  27.93 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.68 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.06 
 
 		 530 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.61 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  28.34 
 
 		 562 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  30.02 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.14 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  28.14 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.49 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  29 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  29.07 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  29.4 
 
 		 572 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  31.24 
 
 		 598 aa  146  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.14 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.23 
 
 		 500 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  24.71 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  24.71 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  28.8 
 
 		 551 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.81 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.72 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  30.33 
 
 		 564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.68 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.63 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  28.83 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  26.3 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.42 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.42 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.42 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  29.44 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.42 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.37 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.13 
 
 		 512 aa  134  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  26.01 
 
 		 570 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.14 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.42 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  22.47 
 
 		 506 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.28 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.27 
 
 		 513 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.14 
 
 		 518 aa  130  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.97 
 
 		 512 aa  130  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.76 
 
 		 509 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  23.09 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.91 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  26.83 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  26.21 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  23.45 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.86 
 
 		 497 aa  126  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.16 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  23.24 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.06 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  24.26 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  23.45 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  23.45 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  27.42 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.25 
 
 		 512 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  24.03 
 
 		 557 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  30.3 
 
 		 567 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.83 
 
 		 500 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.68 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  23.05 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  28.44 
 
 		 566 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>