More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6195 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  100 
 
 
296 aa  613  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  98.31 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  37.01 
 
 
295 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  37.76 
 
 
346 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  40.88 
 
 
305 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  37.55 
 
 
369 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.71 
 
 
292 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  34.52 
 
 
304 aa  186  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  36.67 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  33.92 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  37.23 
 
 
323 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  36.88 
 
 
300 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  39.77 
 
 
296 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  36.84 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  38.64 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  36.63 
 
 
319 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  36.88 
 
 
306 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  37.1 
 
 
300 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  38.58 
 
 
320 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  35.25 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  35.36 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  39.2 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  34.72 
 
 
348 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  35.09 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  33.45 
 
 
303 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  31.67 
 
 
339 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  32.41 
 
 
304 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  30.03 
 
 
303 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  29.45 
 
 
295 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  27.59 
 
 
298 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  31.45 
 
 
287 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  28.72 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  33.46 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  28.24 
 
 
306 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.77 
 
 
301 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
292 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  31.94 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.36 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  26.1 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  26.55 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  24.91 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  29.26 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  27.43 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  28.3 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.22 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  28.06 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.89 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.52 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.89 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  28.9 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  28.9 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  28.39 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  24.63 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  28.57 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  24.56 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  27.21 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  26.18 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  29.13 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.39 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  27.05 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  24.21 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.63 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>