More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6112 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  96.7 
 
 		 424 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  54.88 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  36.87 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  35 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  33.43 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 452 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.76 
 
 		 450 aa  139  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.42 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.42 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.33 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.47 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.84 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.47 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.17 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.73 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.73 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  24.47 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.94 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  28.31 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.34 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.15 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>