More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6086 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 288 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 313 aa  315  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  35.03 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.14 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 508 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.93 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.92 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  22.68 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  36.94 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  42.57 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 515 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2912  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  42.57 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 462 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 533 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0326  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  23.43 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  33.98 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  43.02 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>