More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6042 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 378 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  68.93 
 
 		 383 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  68.72 
 
 		 382 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  68.18 
 
 		 382 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  67.91 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  68.18 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  63.14 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  63.14 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  62.6 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  60.27 
 
 		 386 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  60.57 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  56.62 
 
 		 385 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  56.18 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  42.36 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  37.27 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  37.92 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  35.21 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  36.68 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  37.92 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  37.91 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  37.22 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  35.69 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.61 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.68 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  36.24 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  34.44 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  32.01 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.64 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.58 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.58 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  33.6 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  31.21 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.99 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  31.9 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.14 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.12 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  30.34 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.34 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  31.79 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  31.79 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  32.16 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  33.89 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.54 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.45 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.59 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  31.34 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  31.07 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.17 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 		 430 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  29.62 
 
 		 412 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  30.63 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.17 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.3 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.15 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  32.7 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.45 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  29.68 
 
 		 404 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.64 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.11 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.22 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  27.76 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.22 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.22 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.22 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  29.22 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.97 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  29.85 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07382  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01460)  29.9 
 
 		 422 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  29.85 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.36 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  30.86 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  27.81 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  29.78 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  31.42 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  29.85 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  27.14 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  28.73 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.84 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  28.35 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.69 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.66 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  25.74 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>