More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5985 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
301 aa  576  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.35 
 
 
301 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  48.12 
 
 
299 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  47.78 
 
 
299 aa  213  4e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  47.78 
 
 
299 aa  213  4e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  46.36 
 
 
298 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  47.89 
 
 
299 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  42.29 
 
 
291 aa  199  4e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  46.42 
 
 
298 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  40.93 
 
 
314 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.12 
 
 
295 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  36.13 
 
 
287 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  42.81 
 
 
298 aa  165  1e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  36.86 
 
 
287 aa  163  4e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  35.77 
 
 
287 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  35.27 
 
 
303 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  35.27 
 
 
303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  34.08 
 
 
304 aa  148  1e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  34.46 
 
 
304 aa  147  2e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  34.73 
 
 
304 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  34.73 
 
 
304 aa  147  2e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  32.21 
 
 
303 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  34.46 
 
 
304 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55461e-07 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  33.59 
 
 
304 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.88959e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  140  4e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  36.73 
 
 
312 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  32.44 
 
 
319 aa  131  1e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  36.12 
 
 
331 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 
340 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  34.08 
 
 
304 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  33.79 
 
 
302 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.16 
 
 
327 aa  120  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 
335 aa  119  4e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 
356 aa  115  9e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 
294 aa  109  4e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.77 
 
 
309 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.36 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.01 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.68 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  27.01 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.31242e-05 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  26.2 
 
 
301 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  26.2 
 
 
301 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  26.2 
 
 
301 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  26.2 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25.83 
 
 
301 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.28 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.28 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.28 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.28 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.28 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.28 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.28 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.91 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.91 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  25.46 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  30.18 
 
 
279 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  25.46 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  25.56 
 
 
301 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  25.46 
 
 
301 aa  84.3  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
292 aa  82.4  9e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.8 
 
 
296 aa  82  1e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
287 aa  82  1e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.80606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  25.56 
 
 
301 aa  79.7  5e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.6 
 
 
304 aa  79  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
304 aa  79  1e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
305 aa  78.2  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.9 
 
 
296 aa  78.2  2e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.99 
 
 
301 aa  77.8  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.86 
 
 
312 aa  77.8  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
305 aa  78.2  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  26.98 
 
 
296 aa  77.4  3e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
325 aa  75.1  1e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
317 aa  75.1  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
283 aa  75.1  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  30.08 
 
 
316 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 
304 aa  74.3  2e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 
293 aa  74.3  2e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.77 
 
 
308 aa  73.9  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
302 aa  72.4  9e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.02 
 
 
294 aa  71.6  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
306 aa  72  1e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 
340 aa  71.6  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.67 
 
 
306 aa  70.5  4e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
367 aa  70.1  5e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
305 aa  69.7  6e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  69.3  7e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.15 
 
 
293 aa  69.3  7e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.08 
 
 
296 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.63 
 
 
301 aa  68.2  1e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.57317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.76 
 
 
330 aa  67.8  2e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
286 aa  67.8  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.03 
 
 
296 aa  67.4  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  67.4  3e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.96 
 
 
305 aa  67.4  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.44 
 
 
331 aa  67.4  3e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.31 
 
 
286 aa  66.6  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.96 
 
 
305 aa  66.6  5e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>